Los Sindicatos Comarcales son la representación descentralizada y Organizativa de la Federación en los distintos territorios de la Comarca, lo que supone una mayor y mejor participación de los afiliados y afiliadas en la vida orgánica de la misma.

Los Sindicatos Comarcales están constituidos por las Secciones Sindicales. Los trabajadores y trabajadoras, desempleados y desempleadas, afiliados y afiliadas a la Federación de Servicios Públicos dentro del ámbito territorial de la Comarca.

Los Sindicatos Comarcales constituidos se regirán por el Reglamento de Funcionamiento y tendrán sus correspondientes órganos de dirección, decisión y control, que estarán en consonancia con el presente Reglamento.

La Comisión Ejecutiva del Sindicato Comarcal se compondrá como máximo de tres Secretarías: Secretaría General, Secretaría de Organización y Secretaría de   Administración, así como de un número de Secretarías Comarcales determinadas por el Congreso del Sindicato Comarcal.

En la actualidad hay seis Sindicatos Comarcales: Norte, Este, Sureste, Sur, Suroeste y Oeste